深圳注册公司的基本流程如下：
1.在线填写企业设立信息。
经办人注册政务服务网账户，进入系统登录到网上注册系统之后，可以点击“主体登记”栏目中的“商事主体设立登记”按照流程指示进行公司设立申请，主要内容包括名称自主核准，填写注册资本、注册地址、股东及股份比例、公司经营范围等公司基本信息，主要人员如法人、股东还要在线完成实名认证，系统会弹出提示的。
2.用数字证书在线签名。
在网上注册系统填报完所有公司设立信息之后，需要下载《深圳市企业设立登记一照一码登记申请书》PDF文件进行签名，申请表包含企业设立申请书，公司章程，公司高管任职书，企业住所信息表，属于一人有限公司的还有承诺书，这些文件有签名的地方都要完成签名，尽量检查签名是否准确和完成再点击提交，签名完毕确认无误提交即可。
3.等待登记机关审核结果。
完成提交之后等待的结果如果是准予设立，即可前往工商窗口领取营业执照，若被驳回工商部门也会给出驳回的详细原因，企业经办人可以根据驳回的原因整改之后再提交即可，涉及到需要去现场配合说明情况的也有，按照要求办理即可。
4.注册公司的一些注意事项。
网上注册公司前期公司的筹备要放在前面，公司的基本信息和组织架构要提前确定，这样申报的时候按照约定好的内容填报能节约时间。有几种情形需要注意：
设立在深圳前海的公司，必须先通过前海商务秘书公司系统办理企业地址挂靠，地址挂靠办结之后才能提交企业设立PDF签字文件，不然会被直接驳回，驳回的原因就是前海的公司需先办理地址挂靠，不予受理。
注册地址不要随便填写，深圳注册公司要填写房屋租赁编码一一对应，没有房屋租赁编码的地址或者随便填写的地址也会被驳回。深圳其他区域不要填写房屋租赁编码，也不能随便填写注册地址，以免被工商部门监管到载入经营异常名录。
法人名下不要有异常公司，比如法人名下若有公司税务非正常的话，新公司的法人需要更换否则注册下来也不能正常报税，公司也不能正常运作，在注册公司的时候，要考虑这种情况。
