转厂过程中有两个主体：转出方和转入方。转入方已固定是加工贸易企业了，但转出方可以是任何性质的企业。
1、一般企业销售产品给加贸企业要用“间接转厂”，就是供应商把产品出口到保税区，加贸企业再用加贸手册从保税区报关进口。这可以解决一般制造企业与加贸企业的转厂问题。同时，加贸企业进口是保税的，而供应商出口后可以向税务局申请出口退税。
2、同是加工贸易的两家工厂，因为隶属的主管海关不一样、手册备案的货物信息有差异，通过保税区操作，实现转厂交货的目的。双方工厂分别拿手册资料到保税区海关报关出口或进口，而且载货车辆入区不需卸货，当天即可出区通关进口，实现“一日游”操作(实际只需3个小时左右)。
3、加贸工厂供货给一般工厂，即出口转内销，也是“转厂”模式：加贸工厂将货物以手册保税核销的方式出口到保税区(深圳出口加工区)，一般工厂则以一般贸易的方式征税进口国内。
案例：江苏加贸企业A从国外进口料件冷缩管，在东莞生产出来的冷缩管，通关保税区一日游出口退税后复进口核销。东莞另一加贸企业B从国外进口料件冷缩管，在国内生产出成品冷缩管，出口报关退税然后复进口核销。前段是通过广东保税区来完成转厂核销的过程，转厂放行出闸以后，司机交货到物流门店，门店装车发往苏州交货完成整个转厂交易的过程。