港澳通行证的商务签证是指三个月可以二次可以上赴港澳，或一年可以二次以上赴港澳；申请人想办理往来港澳通行证的商务签证（S）签注，申请人所在企业或经营单拉需要达到一定的条件，符合深圳市公安出入境的要求的企业或经营单位每年才会有配额，申请人必须该企业或单位法人、股东、总经理等重要成员。
条件：
企业年纳税额为5-10万、创外汇20-50万美元或减免税企业注册资本50-100万的单位，可以为负责人申请3个月多次港澳商务签注，备案人数不得超过2人
企业年纳税额为10-20万、创外汇50-120万美元或减免税企业注册资本100-200万或属于高新技术企业注册资本为200万元以下的单位，可以为营业执照持有人或企业股东等，申请3个月多次港澳商务签注，且备案人数不得超过4人。
是由深圳市政府引进的出国留学人员所创办的企业，若未达到商务登记备案条件的，可配给1个人的名额（仅 限创办该企业的出国留学人员），可以申请3个月多次港澳商务签注或者1年多次香港商务签注。
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持有《广东省公安厅车辆及驾驶员驾车入出境批准通知书》，车辆年审有效期超过6个月的单位，可以根据通知书上注明的司机和后备司机申请名额，并可申请3个月多次或1年多次港澳商务签注。
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持有《广东省公安厅车辆及驾驶员驾车入出境批准通知书》，车辆年审有效期不足6个月的单位，可以根据通知书上注明的司机和后备司机申请名额，并可申请3个月多次港澳商务签注。
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如是香港、澳门、外国企业驻深圳分支机构或者代表处的，可以配给1个人的名额，并可申请3个月多次港澳商务签注（该经营执照持有人或者负责人）。
