首先明确一点：电子普通发票和普通增值税发票是使用的时候，效力是一样的；普通发票可作为成本费用，作为企业所得税税前列支；如果是农产品收购发票，可以抵扣进项税额。
电子发票表面外观上和普通纸质发票并无二致，包括发票代码、开票机构、金额、二维码等信息。电子发票的推行，是国家为了更好的监管税收，以及解决纳税人使用纸质发票容易遗失、申领发票手续不便捷、监控有盲区等问题。
（以下是从不同方面，电子发票和纸质发票的具体区别）
1、形式上的区别：电子发票就是电子形式的发票；增值税发票是纸质的发票，分为增值税普通发票和增值税专用发票；
2、抵扣上的区别：电子发票原来只有电子普通发票，现在也有了电子专用发票；如果是增值税专用发票，不论是纸质的专票、还是电子专用发票，都可以正常抵扣；
3、取得方式的区别：电子发票是通过电子发票服务平台查询、下载取得的；传统纸质发票是由销售方直接开出来，然后购买方拿到第二联或者第三联用于税前抵扣；
4、发票联数的区别：电子发票只有一联，供收票方、开票方分别下载使用；纸质版的增值税普通发票有2联和5联两种。
另外，根据《增值税专用发票使用规定》第四条，专用发票由基本联次或者基本联次附加其他联次构成，基本联次为三联：发票联、抵扣联和记账联。还有的为六联，这是在四联的基础上加上的副联，但是所有的增值税发票都必须是三联及以上，即有发票联、抵扣联和记账联。
