1、增值税
增值税的纳税人可以划分成两类，一类是一般纳税人，一类是小规模纳税人。二者区分的标准为：工业企业，销售额超过50万;商业企业，销售额要超过80万。营改增的试点企业目前标准是500万。
上述标准说的是如果公司的销售额达到上述的标准就一定是一般纳税人了。如果达到这个标准，而没有及时申请一般纳税人，税收上会有处罚的。
如果基金公司它的销售额没有达到上述标准，也是可以自主申请的，向主管税务机关提出一般纳税人的申请，一般只要会计核算健全，有固定的生产经营的场所，即可给予一般纳税人的资格的。
1)一般纳税人
增值税应纳税额等于销项税额减去进项税额。
销项税额根据销售额计算，按照一定的税率，一般来说私募的基金有一些涉税服务，或者买卖金融商品，是按6%的增值税税率来确定销项税额的。再减去进项税额，进项税额就是公司里日常一些经营活动当中取得的增值税专用发票上面确定的税额，税率可能是6%的，可能是3%的，也可能是17%的。
2)增值税小规模纳税人
应纳税额等于不含增值税的销售额乘以征收率，它没有进项税额抵扣的问题，这种计算方式和原来营业税的方法比较像。
3)公司型和合伙型的增值税
对于增值税来讲，公司型的和合伙型的主体从增值税的纳税主体来说，都是应当缴纳增值税的单位，二者在增值税上是不存在差异的，这可以从销项端和采购端分别来介绍。
(1)销项
私募证券投资基金的主要业务可能就是买卖股票、债券，或者是买卖金融商品这样的一些业务，交税是按照营改增【2016】36号文的规定，它属于金融服务下面的金融商品转让服务的税目。
金融商品转让按照文件规定，是指转让一些外汇、有价证券、非货物期货和其他金融商品所有权的业务活动。其他金融商品转让包括基金、信托、理财产品等各类资产管理产品和各种金融衍生品的转让。
那对于私募证券投资基金来说，金融商品买卖的计税方法是按照卖出价扣除买入价之后的余额作为销售额。转让金融商品出现的一个正负差，按照盈亏相抵后的余额作为销售额。如果说相抵之后是正差，我们就按照规定缴纳增值税，按照正差除以1.06，再乘以6%，按照这样的计算方式。如果是负差，就转入下一纳税期间，与下一纳税期间的金融商品的销售额相抵。年末的负差，是不能转入下一会计年度的。
金融商品的买入价可以选择按照加权平均法，或者移动加权平均进行核算，选择之后36个月之内不能变更，并且金融商品转让不得开具增值税专用发票。以上就是私募证券投资基金买卖股票、债券的增值税的计算方法，这个方法其实和原来营业税的计税方法差不多，只是按照增值税原则做了一些调整。
(2)股权投资基金的销项
营改增之后，对于一些企业的股权转让是否征收增值税现在其实没有明文规定。之前在营业税的时候，财税【2002】191号文件里面明确的规定对股权转让是不征收营业税的。
根据营改增政策的延续性和国家领导层的指示，股权转让今后也是不征收增值税的。
上述股权转让的情形，只针对纯股权转让，没有通过像新三板这样的交易平台。股权基金在退出时经过新三板的转让，是否交增值税现在国家税务总局尚没有明确规定，各地也有不同的政策。
如果股权是通过新三板进转让，它即具有了金融商品属性，可以按照金融商品转让的增值税目来征收增值税。
(3)进项
私募股权投资和私募证券投资的进项部分差别不大。购买固定资产、购买的办公楼等、办公用品，办公场所，水电费，以及法律、会计，或者是税务、咨询服务的购买，均属于进项范围。可以取得增值税专用发票，抵扣进项税额。
4)契约型基金的增值税
契约型基金在税法上采用的是纳税主体征税原则。由于契约型基金是多方通过基金合同的形式组成，不确认它为纳税主体，按照目前的政策来讲，不缴纳增值税。但不包括管理人和投资者。
