食物链减耗环的设计
人工生态系统的生物生产过程中由于一些有害虫、兽会造成生物产量损失，甚至会生态系统的崩溃。这些有害的生物种群称为食物链的耗损环。利用生物措施进行害虫害兽的防治，抑制耗损环的生物种群称为食物链的减耗环。
减耗环的设计包括：（a）查清当地主要生产型生物种群的对抗性生物类群（耗损环），并研究解析这些对抗性种群的发生发展规律；（b）选择对耗损环生物种群具有拮抗、捕食、寄生等作用，但对其他生物种群无害的生物种群；（c）建立耗损环生物种群的保护、放养与人工繁殖的工艺技术体系；（d）根据耗损环的种群数量与发生规律，来确定减耗环生物种群的数量配比。
④食物链的解环设计
利用食物链的解链技术，使有害物质降解或脱离与人类相联系的食物链。
食物链的解链设计一般包括：(a)在生态工程设计过程中，把生态工程的产品改变用途，使它们脱离与人类食物相连的食物链，切断污染物进入人体途径；（b）改变生态工程人工种群的类型，使它们的产品不可进入人体；（c）加入一个或几个生物种群，使那些对人类有害的物质降解，或者对有害的物质不吸收、不富集。
食物链的解链重要的是选择佳的解链部位和方法：则什么时间、哪个环节解链损失小，怎样做到既达到了解链的目的又可以增加收益。
⑤食物链的复合环选择与设计
自然界中有一种生物，不但可以作生态工程的减耗环，它又是人类所需要的经济产品，称为复合环。如稻田养鱼，杂草为饵料，鱼粪为肥料。
⑥加工链的设计
生态工程产品的加工，是提高工程效益的有效途径。这种加工链与食物链有极其相似的意义。加工链的设计与生产环的设计基本相同，只是加入的食物链种群不是一般的生物，而是以人类这个特殊的生物种群来替代。