目前，出口加工区正在申请转型升级为综合保税区，预计将在2016年内获批。在转型为综合保税区后，出口加工区拟进一步整合优化现有的保税加工、保税物流业务，加快发展研发技转、检测维修。在发展新兴业态方面，近期拟结合申请跨境电商试点政策，建设集展览展示和跨境电商于一体的进出口商品展销中心。
近期我国产品出现大量的非质量原因的退运，主客观原因都有。特别是标签、包装和运输的影响，其实都可以有效避免，关键问题就是在出口前与外商做好沟通，并增强企业的法律意识和自控能力。
另外还有一些其他原因比如：
1.由于政治经济等因素客户拒付尾款。客户毁约或其他一些因素,造成产品出口了不得不退回。
2.单据质量等不合格导致客户拒收货物。比如:包装不合格,标签不合格,质量不合格,出口了要求退货的。
一、退运回工厂手续非常麻烦：
1:、首先要向海关提供质量不符的国外证明
2、交纳保证金、原出口的所有报关和商检资料等，
3、海关审核快也需要一个月，
4、产生昂贵的码头费。
5、若海关审核不通过，则需要从新申请或退回国外，有些客户甚至半年才能退回工厂，同时退运货物会使企业产生不良的海关信誉和记录。
十年来，深圳进出口内生动力增强，民营企业进出口快速增长、比重提高。深圳持续优化的营商环境，激发了企业活力和创造力。据海关统计，2012年至2021年
深圳出口加工区有境内关外的政策，即是在国家边境内，但又不是国内海关所管辖的，货物从国内进入保税区等于出口，从保税区进入国内等于进口（要报进口关），地位和香港一样。因此从国外退运的货物退到保税区还等于货物留在国外，还没有办理进口申报,所以无需向海关申请退运货物。
保税区退运：
1、从国外把需要退运的货物申请退运至香港；
2、安排中港车经皇岗口岸在海关系统申请通关一体化申报运至深圳出口加工区检测维修中心；
3、在深圳出口加工区的闸口窗口入海关停车场，取IC卡捆绑后等待系统放行后入保税区仓库检测维修中心；
4、安排维修场地，企业备齐物料及工具，并安排工程师及工人入检测维修中心进行检测维修或者更换包装；改换完毕后装柜直送香港码头或转关盐田码头出口。
5、保税区退运遵循六大免证原则：免保证金、免中检报告、免退运报告、免3C、免税金、免其他的报关单证.
据海关统计，2012年至2021年，深圳民营企业进出口总额由1.03万亿元快速增长至2.16万亿元，增长1.1倍，占深圳进出口总值的比重从34.8%提高至60.8%，民营企业在深圳对外贸易中主力军的作用愈发明显。
