保税仓储区别于一般仓储之处在于保税仓储的监管力度要大得多。货物在仓库中的全周期需要能够实时掌握，因此报税仓储的管理信息系统要求也高很多。库存信息化通过库存物品的入库、出库、移动和盘点等操作对企业的物流进行全面的控制和管理，能够降低库存，减少资金占用，杜绝物料积压与短缺现象，提高服务水平，保证生产经营活动的顺利进行。
1.保税区仓库出租，货物保税仓储：保税区接收出口和境外入区货物仓储，除国家禁止进出口的商品外，园区内可保税储存各种贸易方式的进出口货物及其他未办结海关手续的货物。国外货物进入保税区仓储，关税豁免，可以在保税区进行仓储、贴标等。也可以分批一般贸易报关进口到国内。
2.保税区开展货物包装、换包装、流通性简单加工：园区物流企业可以对所存货物开展不改变货物物理性质的流通性简单加工和临港增值服务；保税区内集中采购货物，对货物进行分拣包装、组合包装、打膜、加刷码、刷贴标志、改换包装、拼装、拆拼箱等具有商业增值的辅助性作业。例如印刷图书出口到保税区进行包装，分拣再集中出口到国外；国外过境货物进入保税区、包装材料从国内采购出口到保税区进行包装分拣再出到国外，这样可以大大节省货物存在香港的仓库成本和人工成本；
3.国际采购贸易和国际配送：根据需求面向国内外两个市场进行全球采购和国际分拨、配送、深度分销等。例如沃尔玛零售店国际采购货物暂存保税区仓储、分拣再配送到全国沃尔玛零售店；美国采购的进口润滑油到保税区进行分装、贴标再部分一般贸易进口到国内，部分出口到第三方国家（出到第三方国家部分货物在保税区关税豁免）。
4.国际转口贸易（主要是保税区仓储、分拣贴标、包装）：对国内、国外集装箱货物（包括来自不同国家、地区的）进行快速拆拼、集运、转运至境内外其他目的港。同时，可开展转口贸易为核心的服务贸易活动，代收付汇，提升口岸功能。
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