综合保税区是我国开放层次高、优惠政策多、功能齐全的海关特殊监管区域。全国海关对标国际先进水平，简化业务流程，提升监管效能，持续改善营商环境和创新环境。支持区内开展全球维修业务和高技术含量、高附加值的再制造业务，推动综合保税区发展成为具影响力和竞争力的加工制造中心、研发设计中心、物流分拨中心、检测维修中心和销售服务中心。
位于深圳出口加工区保税区里面，拥有保税仓库3万平米，其中红酒、食品恒温仓5千平米，的报关团队以及经验丰富的物流顾问，现代化的装卸平台、24小时监控设备以及消防设备。为全国企业提供进出口物流方案策划以及实施。
1.保税仓储
：除国家禁止进出口的商品外，园区内可保税储存各种贸易方式的进出口货物及其他未办结海关手续的货物。
国内加工贸易企业（进料加工贸易企业和来料加工贸易企业）从国内采购原材料，可以让原材料供应商先完成货物出口到保税区仓储，再根据生产的需要分批用手册进口，达到企业零库存的目的。
加工贸易企业保税进口料件生产的产品出口到保税区完成手册核销，仓储，再由国内买方进口，达到转厂内销目的。
2.保税区包装，组装，流通性简单加工和增值服务
：深圳出口加工区内可以对所存货物开展不改变货物物理性质的流通性简单加工和临港增值服务，包括分级分类、分拆分拣、分装、组合包装、打膜、加刷码、刷贴标志、改
换包装、拼装、拆拼箱等具有商业增值的辅助性作业。比如贸易商从国外采购的产品先暂存保税区仓库，在中国采购包装材料出口到保税区对货物进行包装贴标，再出口到国外。代替香港仓库高昂的仓储以及人工成本。
3.保税区集拼，出口退税，拼柜出口：
很多国外企业在我国进行采购,因品种繁多,单一的供应商供货量达不到整柜发货,若以包柜发货,成本增加很多。如以我司保税仓库为集散地，要求国内供应商将货物出口到我司仓库，国外供应商进境交到保税区我司仓库，在我司仓库进行分拣，拼箱拼柜，再发到全球各国分销商处，大大降低仓储成本、人工操作成本与运输成本。
4.出口货物退运，办理出口退运货物保税区维修
海关总署发布的数据显示，目前，全国综保区内已有50余家企业开展承接区外委托加工业务，涉及医药、电子设备、机电产品、飞机等行业。受综保区政策优势吸引，企业入区意愿显著增强。今年1—10月，全国综保区新注册企业1614家，注册数量同比增长57.5%。
