医疗器械CE认证是构成欧洲指令核心的"主要要求"，即只限于医疗器械不危及人类、动物和货品的安全方面的基本安全要求，而不是一般质量要求，协调指令只规定主要要求，一般指令要求是标准的任务。准确的含义是：CE标志是安全合格标志而非质量合格标志。
医疗器械CE认证这三个指令分别是：
1.有源植入医疗器械指令(EC-Directive90/385/EEC)。该指令适用于心脏起搏器、可植入的胰岛素泵等有源植入医疗器械，于1993年1月1日生效，1995年1月1日强制实施。
2.医疗器械指令(EC-Directive93/42/EEC)。该指令适用于除90/385EEC指令和98/79EEC指令规定以外的一般医疗器械，于1995年1月1日生效，并于1998年6月14日强制实施。
3.体外诊断医疗器械指令(EC-Directive98/79/EEC)。该指令适用于血细胞计数器、妊娠检测装置等体外诊断用医疗器械，于1998年12月7日生效，2003年12月7日强制实施。
这三个指令中，主要的是医疗器械指令，即93/42/EEC。根据该指令，医疗器械CE认证将产品分为三类：
Ⅰ类医疗器械：如普通医用检查手套、病床、绷带;
特殊I类医疗器械：如灭菌检查用手套、创口贴、、血压计;
Ⅱa类医疗器械：如手术用手套、B超、输液器;
Ⅱb类医疗器械：如缝合线、接骨螺钉;
III类医疗器械：如冠状动脉支架、心脏瓣膜。
