申请ISO9001质量管理体系流程有5个程序，具体步骤如下：
一、申请人提交一份正式的应由其授权代表签署的申请书。申请书或其附件应包括：
1）申请方简况，如组织的性质、名称、地址、法律地位、以及有关人力和技术资源。
2）申请流程的覆盖的产品或服务范围。
3）法人营业执照复印件，必要时提供资质证明、生产许可证复印件。
4）咨询机构和咨询人员名单。
5）*近一次国家产品质量监督检查情况。
6）有关质量体系及活动的一般信息。
7）申请人同意遵守流程要求，提供评价所需要的信息。
8）对拟流程体系所适用的标准其他引用文件说明。
二、流程中心根据申请人的需要提供有关公开文件。
三、流程中心在收到申请方申请材料之日起，经合同评审以后30天内作出受理、不受理或改进后受理的决定，并通知委托方（受审核方）。以确保：流程的各项要求规定明确，形成文件并得到理解；流程中心与申请方之间在理解上的差异得到解决;对于申请方申请的流程范围，运作场所及一些特殊要求，如申请方使用的语言等，流程机构有能力实施流程；必要时流程中心要求受审核方补充材料和说明。
四、双方签订“质量体系流程合同”当某一特定的流程计划或流程要求需要做出解释时，由流程中心代表负责按认可机构承认的文件进行解释，并向有关方面发布。
五、对收到的信息将用于现场审核评定的准备。流程中心承诺保密并妥善保管。
