根据欧洲医疗器械法规（MDR），医用PET扫描仪的CE认证可以通过以下步骤进行办理：
产品分类和风险评估：确定医用PET扫描仪的产品分类，并评估其风险等级。根据MDR的规定，风险评估需要考虑产品的设计、用途、材料等因素。
技术文件准备：制造商需要编制符合要求的技术文件，包括产品描述、设计和制造过程的详细信息、材料和组件的规格、性能测试结果、风险评估报告等。
符合性评估：医用PET扫描仪的符合性评估可以采用全面质量保证体系评估（Annex IX）、基于型式检验的符合性评估（AnnexX）联合基于产品合规性验证的符合性评估（Annex XI）或者Annex II加Annex III以及AnnexXI。根据您提供的信息，大多数制造商可能会选择全面质量保证体系评估（Annex IX）作为评估路径。
认证机构评估：如果选择全面质量保证体系评估（AnnexIX），制造商需要建立、实施和维护质量管理体系，并确保产品符合法规要求。认证机构将审查技术文件、进行必要的测试和评估，以验证产品的符合性。
CE标志申请：一旦符合性评估通过，制造商可以向认证机构申请CE标志。认证机构将核实产品的符合性，并颁发相应的证书。
请注意，具体的认证办理流程可能会因制造商所在地和所选认证机构而有所不同。建议您与欧洲认证机构或专业咨询机构联系，以获取准确和蕞新的办理指导。
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