下列公司不能直接注销：
(1)文件不完整
由于长期不经营，找不到营业执照等证件。这时候就要先挂失，补齐所有丢失的证件，才能注销公司。
(2)税收异常
要取消公司的税，就要先取消税。如有欠税或税收异常，不能注销。需要先处理税务异常，补齐应缴纳的税款，如果涉及到罚款。这时候公司就可以注销了。
(三)股权变动不纳税。如果公司之前有过股权变更，但没有进行税务变更，此时不能直接注销公司。在你注销公司之前，你必须改变税收。
(4)无凭证、账簿和报表
没有公司凭证、账簿、报表等财务资料，不能直接注销公司。因为公司注销的时候需要查看Zui近三年的纳税申报单。这时候只有把过去的账都补齐了，才能注销公司。
(五)公司的分支机构或子公司未注销。
如果要注销母公司，必须先注销母公司下的所有分公司和子公司，才能注销母公司，否则母公司是没办法注销的。
如上述情况，公司不能直接注销登记，只能在恢复正常后注销登记。
不注销公司有什么坏处？
1.工商黑名单公示：工商企业信用网网上公示，随时可查。
2.个人征信黑记录：全国个人征信网在个人征信系统有记录。
3.无法在其他公司担任企业高管、法人代表等职务。
4.限游、限飞、高铁。
5.无法贷款买房：个人信用记录被黑，银行信用问题导致无法贷款。
6.影响孩子教育：孩子择校受限。
深圳公司注销流程
简易注销流程:网上公示(必须超过25天)税务注销银行账户注销社保账户注销公示25天后公司执照注销公司印章注销。
注销的一般程序：成立清算组清算组备案制作清算报告网上公示或报纸刊登注销税务注销银行账户注销社保账户网上公示或报纸刊登45天后注销公司执照注销公司印章。