全自动多重免疫荧光芯片分析仪在中国进行国内械字号（国产医疗器械注册证）的注册时，可以按照以下步骤进行：
1.准备注册申请材料：收集和准备需要的注册申请材料，包括但不限于以下内容：
-产品技术规格和描述
-设计图纸和制造工艺流程
-产品性能和临床数据
-材料成分和供应商信息
-质量控制体系文件
-产品标签和说明书等
2.委托注册代理：国外生产厂商通常需要委托一家在中国注册的医疗器械注册代理（Medical Device RegistrationAgent），代表您进行注册申请。
3.提交注册申请：将准备好的注册申请材料提交给中国国家药品监督管理局（NMPA）。
4.审核和评审：NMPA将对您的注册申请进行审核和评审，可能会要求补充材料或提出问题。他们将评估您的产品的安全性、有效性和符合性。
5.现场审核：NMPA可能会派遣审核员到您的生产厂商进行现场审核，以确保质量管理体系和生产条件符合要求。
6.认证决定和发证：一旦审核和评审通过，并符合相关要求，NMPA将核发械字号注册证，证明您的全自动多重免疫荧光芯片分析仪已获得国内注册认证。
请注意，以上步骤仅为一般性指导，实际的注册流程可能因产品特性、法规变化等因素而有所不同。为了确保顺利完成国内械字号注册，建议您详细了解中国NMPA的相关法规和指南，并与注册代理或机构合作，以确保您的申请得到正确处理。