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1.生态运行基于的平台不同
小程序在APP上使用，而微信小程序是在微信平台使用。这两个平台有着庞大的用户，但是微信月活跃用户数量要比多，在方面微信更占优势。
2.社交强度不同
微信小程序基于微信运行，在社交方面可以借助微信社交的优势，通过用户好友聊天的形式分享。商家可以通过分享好友、微信群、朋友圈等方式开展社交商。而小程序在社交上会比较弱一些，用户更多的是消费内容而不是聊天交好友。
3.带货方式不同
有比较成熟的短带货模式，比如美食、美妆、服饰等行业可通过选择短的方式来向用户展现自己的商品和服务，还可以通过直播展示为小程序引流。而微信小程序主要通过图文详情的形式销售商品，目前微信小程序也开发了直播功能，上述功能如今在微信小程序上也可以实现。
4.两种小程序开发成熟度不同
微信小程序发展比较久，目前市面上已有许多易用的开发工具，对于新手还有小程序模板，更方便开发。小程序作为新兴产物开发团队比较少。
5.推荐不同
小程序可通过APP的推荐算法为商家推广的短内容打造爆款，获得更多的推荐吸引更多，但如果没有得到推荐则会少很多。微信小程序需要自己运营，可以通过开展营销活动、社交圈推广宣传、公众号推广等方式来引流，借助用户之间的分享来扩大传播范围，实现用户裂变的效果。
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