自助打印的证书使用彩色双面打印机打印在A4纸上，打印版式包含海关印章签名及企业印章签名，企业无须到海关现场签证。自助打印证书与用空白证书套打的证书具有同等效力。
截至2023年6月，自助打印适用的证书类型包括：《中澳自贸协定原产地证书》《中国—新西兰自贸协定原产地证书》《中巴自贸协定原产地证书》《中智自贸协定原产地证书》《中瑞自贸协定原产地证书》《中冰自贸协定原产地证书》《中格自贸协定原产地证书》《中国—新加坡自贸协定原产地证书》《中韩自贸协定原产地证书》《中毛自贸协定原产地证书》《ECFA原产地证书》《亚太贸易协定原产地证书》（输韩国、印度）、《中国—东盟自贸区原产地证书》（输印度尼西亚、新加坡、泰国）、《RCEP原产地证书》（输新加坡、泰国、日本、新西兰、澳大利亚、韩国、马来西亚、印度尼西亚）、非优惠原产地证书、烟草真实性证书、转口证明书、加工装配证书。
用空白证书套打的证书需使用自海关申领的空白证书，使用针式打印机打印，并到海关现场签证。套打证书适用所有证书类型。