1、缓税优惠
进口货物进境入保税仓库后，可以暂时免交进口关税及进口环节代征税，只有待正式进口时，才缴纳相应税款。因此货物可以实现“整进零出”，尤其对高货值商品，极大的缓解了企业一次性纳税压力，同时也为国内分销或转口国外赢得销售洽谈时间，增加贸易灵活度。
2、缓证优惠
一般情况下，进口货物进入保税仓库免于提交许可证（件），如《农产品进口关税配额证》《自动进口许可证》《黄金及黄金制品进出口准许证》等证件。保税仓库货物只有进口至国内时，才提交相关许可证件，这可以为进口商办理许可证（件）或者免税品进口手续赢得时间。
3、流转优势
货物可在保税状态下在海关特殊监管区域、保税物流中心之间进行自由流转，有助于企业建立面向国际及国内的分拨配送中心。
4、转口获利
保税仓库凭借货物暂不缴纳进口税费及免许可证等优势，可开展国际转口及中转业务。进口货物进入保税仓库短暂仓储后，择机再出口到临近国家或地区，获得可观的转口利润及仓储、运输、装卸等收入。
5、简单加工
在保税仓库等海关保税监管场所中，不得进行实质性加工；经海关批准同意后，可以进行分级分类、组合包装、打膜、加刷唛码、刷贴标志等简单加工。这些增值服务为发展集拼配送、国际中转等提供有力支持。
6、集中报关
又称为“分送集报”，是对保税仓库出库批量少、批次频繁的货物，经海关同意后，货物可以先出库；待一段合理时期后，根据出货频次及货物价值等把某一时间段内的已经出库货物进行集中报关。集中报关将报关手续后置，缩短了通关时间，实现了保税货物随时出库，提升了货物调拨响应速度。
