国内产品进入保税区相当于是出口，因为保税区拥有境内关外的作用，地位与香港是相当的。一般情况的话，国内产品进入保税区主要是分两种情况：
1、保税区区内工厂所需原材料或者是包材损耗品，这样的话，首先可以由保税区区内的物流公司全程操作，报出口报关单和进境备案清单，然后再通过区内货物结转到工厂手册下；也可以是工厂那边报进境备案清单，物流公司报出口报关单，这样的话就不用结转了。
2、国内产品需要出口的，想在保税区做一个集货中心，这样的话也是直接由保税区区内的物流公司直接报出口，再做一个集货动作，送货至一线口岸装船。
3、国内产品进入保税区是想做一个转厂或者是保税区一日游，这种的话呢，就是做一个出口报关和一个进口报关的动作。操作时间大概在1天左右。
保税区的功能是很强大的，除了以上说的3个外，还有以下的功能：
1、在国外采购原材料，供国内生产的制造加工型企业.
2、在国内做深加工结转业务的加工企业.
3、有出口转内销和退税需求或料件成品的手册需核销的企业。
4、在国外采购，在国内分批销售的贸易型企业。
5、有回运返修货物且希望降低操作成本需求的企业。
6、在国内大量采购各类商品，需集中仓储、分拣、拼装出口的企业。
7、在国外大量采购各类商品，需集中仓储、分拣、进口分拨派送的企业。
深圳出口加工区因为远离了市区，交通管制和车辆都会相对少很多，加上靠近坑梓大道和盐田口岸，成为了深圳交通便利的保税区。也正是看中深圳出口加工区的便利性，大型的采购、进口商、出口商都会在深圳出口加工区做保税仓储中心。
