使馆认证和普通公证在性质、证明内容、办理顺序、办理机构和所需材料等方面存在明显的区别。
首先，两者的性质不同。公证是由国家机关根据当事人的申请，依法证明法律行为，保护其合法权益的活动。而使馆认证则主要是外交、领事机关在公证文书上证明公证机关或认证机关签字和印章的真实性，确保公证文书在国外的有效使用。
其次，两者的证明内容也不同。公证主要证明的是民事法律行为、有法律意义的文书等事实的真实性、合法性。而使馆认证则更侧重于证明国内涉外证件的印章、签字等的真实性，以便在国外得到承认和使用。
再者，两者的办理顺序也有所不同。在需要同时办理公证和认证的情况下，必须先办理公证，然后再办理认证。这是因为认证是对公证书上后的盖章、签名真实性所进行的认证，因此公证需要在认证之前完成。
此外，两者的办理机构也有所区别。公证通常可以在国内的公证处直接办理。而使馆认证则需要在外交部或领事馆进行，如果需要进行双认证，可能还需要在文书使用国的驻华使领馆进行办理。
后，所需材料也有所不同。公证通常需要按照公证的要求准备相关证件，如材料原件、身份证等。而使馆认证在大多数情况下，只需要准备好已经公证好的公证书即可，部分国家使馆认证可能需要额外材料。