医疗器械CE认证的办理流程如下：
1. 内部审核
企业需要对自己的医疗器械实施内部审核，以纠正不符合要求的产品，制定并推行系列规范、流程、工艺控制，建立质量管理体系文件，确保产品的质量和安全性，并记录和整理相应的审核资料。
2. 选择认证机构
申请企业需要选择一家符合要求、经过欧洲认可的认证机构，并进行咨询、沟通和签订相关协议。
3. 准备技术文件
准备并提交技术文件，技术文件是申请医疗器械CE认证的主要资料，包括产品的整体描述、功能、性能、材料、制造过程和检测要求等详细信息。
4. 实验室测试
根据医疗器械的等级以及欧盟技术和质量标准的要求，进入实验室检测阶段，申请企业需要提交相应的医疗器械样品，由认证机构检测并出具测试报告，审核组将对测试结果进行审查，对技术文件进行评估。
5. 现场审核
审核组将安排现场审核，验证制造商是否拥有符合欧洲技术和质量标准的质量控制系统，包括物料采购、生产流程控制、质量管控和售后服务等各环节，并检查企业内部文件、记录和数据真实有效的可追溯性。
6. 决定认证结果
审核组根据现场审核和文档审核的结果，决定是否颁发 CE 认证，并公告认证与否的结论，对实施开展企业监管并跟踪管理。
7. 颁发CE认证
颁发 CE 认证后，企业可以在产品上公示码，在欧洲市场自由销售。
需要注意的是，在申请CE认证过程中，申请企业可以通过咨询认证机构、专·业咨询公司或专·业技术人员等渠道获取相关信息，缩短审批周期，提高成功率，需要高度重视相关法规和标准的变化，及时对质量管理体系、技术文件等进行修订并整改。
