1.概念不同：保税区又称加工贸易保税区，即一个国家划出一定范围，在海关监管之下，对制造出口货物而进口的原材料、零部件以及在区内存储、加工、装配后复出境的货物，准予暂缓办理纳税手续。进入保税区货物属于海关保税货物，自进口之日起至全部出口之日止，受海关监管。
2.两者的操作流程不同：保税区内外进出，视同进出口，即按照一般的有关进出口的管理规定来办理相关手续。进出区报关。
3.保税区具有仓储，贸易，加工和展示功能，今后的发展重点是依托口岸强化仓储物流功能。保税区是外向型经济区域，与境外开展业务往来的外向型企业适合在保税区运作。保税仓库，是指经海关批准设立的专门存放保税货物及其他未办结海关手续货物的仓库按照使用对象不同分为公用型保税仓库，即由主营仓储业务的中国境内独立企业法人经营，专门向社会提供保税仓储服务。
扩展资料
保税区的功能定位为“保税仓储、出口加工、转口贸易”三大功能。保税区具有进出口加工、国际贸易、保税仓储商品展示等功能，享有“免证、免税、保税”政策，实行“境内关外”运作方式，是中国对外开放程度高、运作机制便捷、政策优惠的经济区域之一。
保税区能便利转口贸易，增加有关费用的收入。运入保税区的货物可以进行储存、改装、分类、混合、展览，以及加工制造，但必须处于海关监管范围内。外国商品存入保税区，不必缴纳进口关税，尚可自由进出，只需交纳存储费和少量费用，但如果要进入关境则需交纳关税。各国的保税区都有不同的时间规定，逾期货物未办理有关手续，海关有权对其拍卖，拍卖后扣除有关费用后，余款退回货主。
根据现行有关政策，海关对保税区实行封闭管理，境外货物进入保税区，实行保税管理；境内其他地区货物进入保税区，视同出境；同时，外经贸、外汇管理等部门对保税区也实行较区外相对优惠的政策，同时保税区具有进出口加工、国际贸易、保税仓储商品展示等功能，享有“免证、免税、保税”政策,实行“境内关外”运作方式。
