如果企业对菲律宾FDA注册证的审核结果有异议，可以通过以下步骤进行申诉：
了解申诉程序：首先，企业需要了解菲律宾FDA的申诉程序和相关规定。菲律宾FDA通常会在注册申请被拒绝或者审核结果不符合预期时，提供申诉的渠道和程序。
准备申诉材料：根据菲律宾FDA的要求，准备申诉所需的所有文件和资料，包括对审核结果的异议说明、证据材料、申诉表格等。
提交申诉：将准备好的申诉材料提交给菲律宾FDA，通常可以通过电子邮件、邮寄或者在线申诉系统进行提交。
等待处理：菲律宾FDA收到申诉后，会进行审查和处理。他们可能会要求进一步提供证据或者进行补充解释。
参与沟通：在申诉过程中，企业可能需要与菲律宾FDA进行沟通，解释申诉理由，并提供相关的证据和材料。
接受决定：Zui终，菲律宾FDA会对申诉进行评估，并做出决定。企业需要接受菲律宾FDA的Zui终决定，如果申诉成功，可能会重新审查注册申请，如果申诉失败，可能需要进一步考虑其他的解决方案。
需要注意的是，申诉的结果取决于菲律宾FDA的Zui终决定，企业需要积极参与申诉过程，并提供充分的证据和解释，以增加申诉成功的可能性。同时，企业也可以考虑寻求法律咨询或者专业顾问的帮助，以获得更多的支持和建议。
