深圳出口加工区(坪山保税区），具有保税区仓储、物流、入区退税等功能。
1.保税区内包装，分拣，简单加工增值服务。贸易商国内采购货物进保税区集中仓储、包装、分拣、分拨再出口国外；国际采购货物保税区仓储，利用保税区免税功能保税仓储，代替香港仓库节省仓储费和便利的人员出入仓对货物进行清点和分装；除国家禁止进出口的商品外，园区内可保税储存各种贸易方式的进出口货物及其他未办结海关手续的 货物。包括国内货物出口退税入仓分批转厂进口的转厂服务、保税区集拼分拣、包装出口境外，国际进口货物仓储分销。
2.国际转口贸易：保税区开展转口贸易货物仓储、分拣、分销、包装、刷唛、贴标、或者分批征税进口。例如美国出口的货物到坪山保税区卸货仓储，分拣，包装部分进口到国内，部分出到东南亚国家。
案例分享：东莞某游戏机生产企业，以前的生产模式是游戏机的储存设备从国外一般贸易进口到东莞工厂， 东莞工厂生产游戏机外壳以及包装彩盒，在工厂进行加工生产产品全部销售到美国，这样的情况下游戏机的储存设备一般贸易进口到国内需要交关税以及增值税； 现在企业转变原来的生产模式，把组装工艺搬迁到坪山保税区我司仓库， 游戏机储存设备从国外进到坪山保税区是免税的， 国内工厂生产的游戏机外壳以及包装彩盒一般贸易出口到保税区（一般贸易出口可以享受出口退税）， 在保税区内进行货物的组装和包装。 这样企业节省了一大部分进口储存设备的关税和增值税，为企业提高生产率，降低成本。
3.办理出口货物退运，保税区对出口到国外的货物因质量问题需要办理退运返工维修的，可以退到保税区，利用保税区境内关外的特殊性质，免征关税。保税区进行仓储维修。
案例分享：深圳某生产平板电脑的企业年前出口到美国的平板电脑，在美国销售过程中发现货物有质量问题，在美国那边又没有相应的售后服务，于是企业选择把货物退运到香港码头，转关进入深圳坪山保税区仓库进行货物检测返修。货物从国外进入保税区不用申请退运手续、不用做中检证明、也不用交***金。 只需要一天时间就可以把货物从香港转关进入保税区仓库。 企业再安排技术工人进入保税区仓库对货物进行检测以及返修。
4.人区退税：深圳出口加工区具有入区退税政策，国内货物进入保税区视同出口，办理出口报关手续，即可享受退税。保税区一日游报关，解决加工贸易企业国内采购原材料免税进口目的。 解决两个加工贸易企业之间深加工结转转出方部分国内采购料件无法退税问题。
深圳出口加工区：
功能定位：以提升和完善区域功能为重点，走创新驱动发展的道路，强化内引外联功能，主动适应跨国公司业务运作的需求，延伸产业链、提升价值链，向集综合产业、商贸会展、服务创新和保税物流等功能于一体的方向发展，打造高科技制造中心、保税货物集散中心、保税展示交易中心和研发设计检测中心。
空间优化：提高新增产业用地控制标准，引导中小企业向多层标准厂房集中，加快形成保税物流服务业功能区、装备制造产业功能区、电子信息产业功能区和新能源产业功能区。
保税仓库在入境地海关以外的其他海关所在地，受货人或者他们的代理人，应按海关对转运货物的规定，在入境地海关办理海关手续。货物运达保税仓库所在地时，再按上述规定向保税仓库所在地海关办理申报入库手续。
保税区出口包装集拼项目:产品为笔记本套件：鼠标、散热器、音箱、包材国内供应A把出口鼠标到保税区、国内供应商B出口散热器到保税区、台湾供应商C经香港码头送货保到保税区（或经深圳码头转关到保税区），在这个过程中，AB供应商出口到保税区既可以退税或核销，台湾供应商C免税且自由通关进入保税区。另一包材供应商把包材出口到保税区，对以上套件进行包装、分拣、贴唛等等简单加工内容。
