在店里使用的医疗器械需要进行备案。根据我国《医疗器械监督管理条例》的规定，医疗器械分为三类，一类医疗器械需要进行备案，二类和三类医疗器械需要进行注册。
对于在店里使用的医疗器械，需要确定其所属的医疗器械类别。按照相应的管理规定进行备案或注册。
具体操作流程如下：
1. 确定医疗器械类别。根据医疗器械的功能、使用方法、风险等级等因素，将医疗器械分为一类、二类和三类。
2.准备相关资料。备案或注册所需的资料一般包括：营业执照、法定代表人身份证明、产品说明书、产品技术资料、产品检测报告、生产质量管理体系文件等。
3.进行备案或注册。对于一类医疗器械，向当地食品药品监督管理部门提交备案申请；对于二类和三类医疗器械，向国家食品药品监督管理总局提交注册申请。
4. 领取备案凭证或注册证。备案或注册成功后，可以领取相应的备案凭证或注册证。
5. 按照规定进行医疗器械生产、经营和使用。在店里使用的医疗器械，需要按照备案凭证或注册证上规定的条件进行生产、经营和使用。
在店里使用的医疗器械需要进行备案或注册，以确保医疗器械的安全、有效和质量可控。