一：进出口报关，入区退税：
深圳出口加工区与福田保税不同就是深圳出口加工区具有入区退税功能，保税区具有境内关外入区退税政策，办理保税区进出口报关，商检，国内货物进入保税区视同出口，享受出口退税政策；
二：保税商品货物展示：
转口贸易货物，国际进口货物进到保税区替代香港存储暂准进口货物，待售货物，保税商品展示；
三：保税区内开展货物包装、组装、保税简单加工：
保税仓库开展货物简单加工，货物分级分类、分拆分拣、分装、组合包装、打膜、加刷码、刷贴标志、更换包装、拼装等。1.例如国内印刷图书、包装盒分别出口到保税区仓库，在仓库进行分拣包装，再出口到国外；2.国外采购的货物、国内厂家提供包装彩盒，货物及包装彩盒集中到保税区仓库进行包装分拣贴标，再统一出口到国外，利用保税区保税功能，国内出到保税区的包装盒可以退税，国外采购的货物到保税区享受免税仓储。
四：进口货物保税区仓储分批报关：
国外进口货物先进入保税区仓储，在保税区仓库进行货物分拣贴标，包装等，再根据国内买方需求再分批征税进口到国内，为企业减轻全部一起征税的关税压力，和为企业做到零库存。
深圳出口加工区地域优势：
深圳出口加工区地处深圳、东莞、惠州三市交汇处，为广大的加工贸易企业提供便利的通关和物流服务，距深圳宝安机场60公里，至盐田国际集装箱港口、广深铁路编组站均约25公里，离文锦渡、罗湖、皇岗等陆路口岸约40公里，形成了海、陆、空立体交通网络。是目前功能较多的综合保税区之一。
案例分享：
深圳某贸易公司是韩国一电器品牌的中国代理商，深圳代理商先从韩国采购大批量的电器海运到香港，再转关进入深圳出口加工区保税区仓库存放。 在保税区仓库内进行分拣、贴标。部分商品一般贸易进口到中国，部分出到东南亚国家。
优势：韩国采购商品进到保税区关税豁免，再转到国外销售，这部分不涉及到关税问题。利用保税区仓库境内关外的特殊监管性质，从事国际转口贸易货物仓储物流配送。
深圳的保税仓具有以下功能:
(一)存储进出口货物及其他未办结海关手续货物;
(二)对所存货物开展流通性简单加工和增值服务;
(三)进出口贸易，包括转口贸易;
(四)国际采购、分销和配送;
(五)国际中转;
(六)检测、维修;
(七)商品展示;
(八)经海关批准的其他国际物流业务。
