根据内地《外商投资法》，外国投资者包括香港企业在内的外国投资者在内地投资设立企业，按照国民待遇加负面清单管理模式，实行国内和外商投资一视同仁的准入前国民待遇和准入负面清单管理制度。也就是说，香港企业在内地的投资准入将会享受与内地企业相同的待遇，需要遵守内地的负面清单规定，也就是必须要遵守特定的限制和禁止的行业领域。
1、控股方式：
香港公司可以通过在内地注册成立全资子公司，或者与内地合作伙伴共同投资设立合资企业来直接控股内地公司。这种方式简单直接，可以让香港公司直接参与内地子公司的日常管理和决策过程，更好地控制企业运营和财务状况。
香港公司也可以通过收购内地已有企业的股权来实现控股。这种方式涉及到对目标公司的尽职调查、估值和交易谈判等复杂过程，但可以快速进入内地市场并利用已有的业务基础和市场网络。
2、注意事项：
在控股过程中，香港公司需要办理公证事项，获取公证文件。这是因为香港和内地法律体系不同，为了确保香港公司文件的法律效力在内地得到认可，需要由司法部考核后委托的香港律师作为委托公证人出具相关公证文书，并经司法部在香港设立的中国法律服务(香港)有限公司加章转递后赋予香港公证文书在内地合法使用的法律效力。
如果要考虑资金回流，需要排摸海外公司向上穿透的架构是否有中资成分，并确认是否履行相关合规备案手续。回程资金需要解释资金来源，如果合规手续齐全，外管局会进行FDI登记，并需要每年进行各类年报、存量权益的申报，否则可能会被管控。
3、香港企业投资内地公司也需要遵循相关的外汇管理制度。根据中国人民银行的相关规定，境外投资者包括香港企业在内的外国投资者，进行投资和跨境融资，需符合中国外汇管理制度，履行相关外汇登记手续，并接受外汇管理部门的监督。对于香港企业境外投资的外汇管理政策，也要遵守中国人民银行的相关规定和指导。
香港企业在内地投资还需进行税务规划。根据内地税收法规定，香港企业在内地设立企业后，需要依法缴纳相关税费，并遵守内地的税务规定。也可以根据香港与内地签订的双重征税协定，对投资收益进行合理的税务规划，避免重复征税等问题。