企业境外投资备案的办理流程大致如下：
1. 发改委立项：
- 向发改部门及委会部门申请项目，报送项目信息；
- 境内投资人签署各项所需法律文件；
-待发改部门核准或备案，发放核准文件或备案通知书（根据投资金额大小、行业、国家等因素，分为备案制和核准制。如果是涉及敏感行业，无论项目投资金额大小，一律提交商务部和发改委进行核准）。
2. 商务部审批发证：
- 商务部门核准或备案，发放《企业境外投资证书》，企业应在收到证书2年内在境外开展投资。
3. 外汇管理局备案：
- 银行放外汇，外管局监管。投资金额500万美金以上的，需向外管部门汇报；
- 外管部门审核后，向境内企业发放《境外直接投资外汇登记证》。
需注意的是，整个流程耗时将近2-3个月，办理成功后会得到两份分别由商务部和发改委颁发的证书：《企业境外投资证书》和《境外投资项目备案通知书》。
不同地区的具体流程可能会有所差异，以下是某地区的详细办理流程，供你参考：
1.登录商务部业务系统统一平台（企业端）——对外投资合作信息服务（需注册后登录），网址：https://ecomp.mofcom.gov.cn/logincorp.html；
2.首次登陆商务部业务统一平台需先注册企业帐号，登陆成功后进入业务大厅，选择“我的业务”，点击“增加应用”→“经济合作”，选择“投资合作信息”并点击“申请”，选择“境外投资”并确定；
3. 业务办理→资格类选择无纸化版。先填写企业境内主体信息并保存；
4.填报境外投资备案表（可参考表格右上方填表说明），设立并购类企业需先按照系统红字提示要求进入备案（核准）报告→左侧第一项备案（核准）→并购事项前期报告→填报→填写表格上所有内容→保存后，才能填报企业境外投资备案表；
5. 上传电子版材料：申请证书选择本次备案项目→操作→上传电子版文件→保存→上报；
6. 上传pdf格式扫描的所有备案材料。
申请材料通常包括（不同地区可能会有不同要求）：
1. 新设：
- 《境外投资备案表》；
- 境外投资真实性承诺书；
- 营业执照复印件；
- 相关董事会决议或出资决议；
- 对外投资设立的企业章程；
- 可行性研究报告；
- 投资资金来源情况说明及资金证明；
- 投资环境分析评价；
- 其他材料（如境外风险管理制度、企业境外安全生产管理制度和应急预案等）；
- 国资委备案材料、产业布局与投资监管平台截图（国有企业）。
注：企业在境外设立分支机构只需提供1、2、3、4项。
2. 并购：除上述新设备案材料外，还需提供：
- 《境外并购事项前期报告表》；
- 尽职调查报告。
3. 变更：
-非实质性变更（包括投资主体名称变更、境外企业名称变更、出资币种变更、出资方式变更、投资路径变更、既作为投资路径又真实开展经营业务）：变更后的《境外投资备案表》、营业执照复印件或附《工商变更核准单》、原《企业境外投资证书》、其他材料（如《境外中资企业（机构）报到登记表》回执联、境外投资业务情况、近期统计报表截图、视情提供变更后的境外注册文件等）。
-实质性变更（增减资、股权变更、投资主体变更、行业变更、经营范围变更、Zui终目的地变更）：除上述非实质性变更备案材料外，还需提供境外投资真实性承诺书、相关董事会决议或出资决议、变更后的企业章程。增资扩大项目规模或开展新项目、Zui终目的地变更的，还需提供可行性研究报告、投资资金来源情况说明及资金证明、投资环境分析评价、委托大股东办理境外投资备案手续的意见书、外汇汇款凭证、其他材料（如境外风险管理制度、企业境外安全生产管理制度和应急预案等）。
具体办理流程和所需材料建议咨询当地的商务、发改和外汇管理等相关部门，以确保顺利完成备案。
