前期准备阶段（时间不定）
企业需要先确定自身是否符合申请条件，这可能涉及对企业纳税情况、投资情况等进行梳理。例如，对于申请粤 Z车牌（港澳车辆进入内地）的企业，要查看在广东省的纳税额是否达到相应标准。这个过程的时间取决于企业自身财务和运营情况梳理的复杂程度，可能需要数天到数周不等。
收集各种申请材料，包括企业营业执照、商业登记证（适用于港澳企业）、完税证明、车辆登记文件、驾驶人身份证明和驾驶证等。材料收集时间因材料获取的难易程度而不同，像获取企业完税证明可能需要向税务部门申请开具，快则1 - 2 个工作日，慢则可能需要 1 - 2 周时间，尤其是涉及历史纳税数据核对等情况。
申请提交阶段（1 - 2 个工作日）
完成线上申请填写和上传材料（如果有线上渠道）。这个过程一般比较快，熟练操作的话，1个工作日内可以完成。但如果网络出现问题或者对申请系统不熟悉，可能会延长至 2 个工作日左右。
部分地区要求窗口提交材料，需要提前预约提交时间。预约等待时间可能在 1 - 3个工作日左右，提交材料当天，工作人员会对材料进行初步的检查，如检查材料是否齐全等，这个过程一般在 1 个工作日内完成。
审核阶段（1 - 6 个月）
初步审核（1 - 2 周）：相关部门对提交的申请材料进行格式和基本内容的检查。如果材料齐全、格式正确，初步审核通常可以在 1 -2 周内完成。例如，检查企业营业执照是否有效、车辆信息是否完整准确等。
实质审核（1 - 5 个月）：这是对企业资质、纳税情况、车辆合规性、驾驶人资格等全方位的详细审核。对于内地企业申请 FV车牌（内地车辆进入香港），如果纳税情况清晰、企业资质良好、材料完备，审核时间可能在 2 - 3 个月左右。对于港澳企业申请粤 Z车牌，根据纳税额度等条件不同，审核时间也有所差异。如果纳税记录复杂或者车辆有特殊情况等，审核时间可能会延长到 3 - 5个月。在审核过程中，如果发现需要补充材料，每次补充材料后，审核时间会重新计算一部分流程，这也会导致整体审核周期延长。
公示阶段（如有，1 - 3 个月）
有些申请可能涉及公示环节，如对于一些特殊指标或者存在争议的申请情况。公示期一般为 1 - 3个月，公示期间如果没有异议，才会进入终审批环节。
终审批与指标核发阶段（1 - 2 周）
公示无异议后，进入终审批环节，一般在 1 - 2 周内完成。审批通过后，会核发《粤港澳机动车辆往来及驾驶人驾车批准通知书》（俗称“批文卡”）。
车辆备案与牌证安装阶段（1 - 2 周）
企业收到批文卡后，需要携带批文卡和车辆到指定的海关、边检等部门进行车辆备案。备案过程包括车辆信息核对、安装相关电子设备等，这个过程一般在1 - 2 周内完成，完成后车辆就可以安装两地车牌正常往来内地和港澳地区。