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深圳二类医疗器械备案代办费用因不同代办机构和地区而异，一般在1500元左右，具体费用可根据代办机构的收费标准来定。还需要考虑到其他可能的费用，如材料费、地址、人员等。
深圳二类医疗器械经营许可证的办理材料包括：
1、企业营业执照副本原件及公章。
2、法定代表人、企业负责人、质量负责人的身份正明、学历或者职称正明复印件
2、经营场所、库房地址的地理位置图、平面图。
3、.经营范围、经营方式说明;
4、经营场所证明文件，包括房屋租赁合同、产权证明、房产证等 。（注:经营场所和仓库均不得设置在居民住宅内）
办理二类医疗器械经营许可证和备案证明需要提供一系列的材料和资料，还需要支付一定的费用。对于企业而言，选择一家专业的代办机构进行办理，可以减少办理流程中的繁琐和复杂，提高办理效率和成功率