退运货物的处理相对来讲比较繁琐，需要根据货物的不同情况来选择具体的退运方式。
一种方式：一般贸易进口
如果货物出口时按照正常的报关报检程序出口，则一般进口时可以按照一般贸易进口的方式进来。具体又分为以下三种情况：
情况一、已办理退税，退关退货的处理。
出口企业出口货物发生退关退货后，出口企业必须向所在地主管出口退税的税务机关办理申报手续，补缴已退（免）的税款，如果退运的货物已经申报办理退税的，并分别依以下情况予以处理：
（一）如出口企业将退关退运货物加工整理，更换相同规格型号的货物重新出口，或将退运货物退给供货企业不再出口的，出口企业应持有关凭证到其主管退税的税务机关申请办理“出口商品退运已补税证明”及“进货退出及索取折让证明单”（以下简称“证明单”），出口企业或供货企业凭证明单冲减当期销售收入和销项税额。
（二）出口企业将退关退运的货物转为内销的，应持有关凭证到其主管退税税务机关办理“出口转内销证明单”，作为其内销时进项抵扣凭证。
情况二、对于已申报、未办理退税、退关退货的处理
出口企业将购进货物的增值税专用发票（抵扣联）报送给主管出口退税税务机关后，货物发生退货而转作内销或部分内销的，企业须向主管出口退税的税务机关申请办理“出口商品退运已补税证明”，其应退税款在退税总额中予以扣除或比照已退税业务补交税款（已申报资料正常办理退税）。外贸出口企业还应填列“出口货物转内销证明”，经主管出口退税税务机关签章后，作为内销时抵扣进项税额的凭证，企业申报的增值税专用发票（税款抵扣联）留存退税机关。
情况三、未申报退税，退关退货的处理
对出口企业尚未申报退税却已发生退关退货并转作内销的，由于有关原始单据在企业，由出口企业提出书面申请并提供有关原始单据，经主管税务机关审核后，在书面申请报告及原始单据上签注“未办理".
第二种方式：快递进口
如果货物出口时是通过买单或者委托其他进出口公司出口，退运时通常可以考虑快递进口的方式。这样手续简单，时间上比较短，一般当天上午申报，下午即可放行到货。
第三种方式：货入保税区加工复出口（推荐）深圳退运返修，货物退港返修--->>>出口货物退运、深圳保税检测维修与加工
由于深圳出口加工区是保税区有境内关外的政策，从国外退运的货物退到保税区还等于货物留在国外，还没有进入国内海关所管辖的范围无需向海关申请退运货物.此种处理方式的优点是：
1、无须办理复杂的退运手续，无需向海关申请退运货物无需交纳保证金，无须报进口关。取得深圳出口加工区开展退运返修资质，所有操作规范合法，较大限度为企业节约成本，提高产品附加值。
2、复杂问题简单化，节约时间、成本. 特别是从香港码头提货到深圳出口加工区(带办理手续时间)只需三个小时，国内厂家可以自带工人到区内维修，成本是在香港维修费用三分之一。
选择出口保税区的优势:
1、手续简便费用低。无须办理复杂的退运返修手续，无需向海关申请退运货物，无需交纳大额保证金。
2、交通便利。深圳出口加工区连接香港与盐田蛇口，货物从香港进来方便快捷，货物修好可以安排从香港再出，也可以安排从码头再出口，在时间和成本上大大节约，特别从香港码头提货到深圳出口加工区保税区只需3个小时左右，并且维修成本是香港的三分之一。
3、无负面影响。退运返修需要政府相关部门特殊批准，以鹏博雅的名义进到加工区，修好再以我司的名义复出口，对于货主企业不存在海关信誉上的负面影响。
