药品经营许可证的申请流程主要包括以下几个步骤：
一、提出申请
申请对象：
从事药品批发活动的企业，向所在地的省、自治区、直辖市人民政府药品监督管理部门提出申请。
从事药品零售活动的企业，向所在地的县级以上地方人民政府药品监督管理部门提出申请。
提交申请书：填写完整的药品经营许可证申请书，详细说明企业情况、经营药品的类别和范围等。
二、递交材料
在提出申请后，需要递交与所申请经营类型相关的材料。这些材料通常包括但不限于：
企业营业执照复印件。
法定代表人、企业负责人、质量负责人的学历证明、执业资格或职称证明原件及复印件，以及个人简历。
药学技术人员资格证书及聘书。
拟经营场所的平面图、产权或使用权证明，以及设备、仓储设施等情况的说明。
企业质量管理文件，包括保证药品质量的规章制度、仓储设施、设备目录等。
其他根据当地药品监督管理部门要求可能需要提供的材料，如健康证、卫生许可证、税务登记证等。
三、材料补正
受理部门在接收到申请材料后，会根据不同情形进行处理，并告知申请单位补正材料。如果申请材料不齐全或者不符合法定形式，申请单位需要在规定期限内补正。
四、审核阶段
审核部门会对申请材料进行审核，包括对药学技术人员资格、营业场所和仓储设施的条件、药品经营质量管理规范的实施情况等进行核查。审核周期通常为30个工作日。食品药品监督管理部门会根据审核结果作出是否同意筹建的决定，并书面通知申办人。
五、完成筹建
在获得筹建批准后，企业需按照要求进行筹建，包括建设或租赁经营场所、购置设备、招聘人员等。
六、提出验收申请
筹建完成后，企业需向受理申请的药品监督管理部门提出验收申请，并提交相关材料。这些材料通常包括药品经营许可证申请表、企业营业执照、营业场所和仓库的平面布置图及房屋产权或使用权证明等。
七、组织验收
药品监督管理部门在收到验收申请后，会组织专家进行验收，评估企业是否具备经营药品的条件。验收内容包括但不限于营业场所和仓库的实际情况、药品经营质量管理规范的实施情况等。
八、颁发许可证
如果验收合格，药品监督管理部门会颁发药品经营许可证。这标志着申请单位已经通过了药品经营许可的审批，可以依法开展药品经营活动。如果不合格，会书面说明理由，并告知企业享有依法申请行政复议或提起行政诉讼的权利。
请注意，不同地区的具体办理流程和要求可能有所不同。在申请前，建议企业详细咨询当地药品监督管理部门或专业机构，以确保申请过程顺利。