绿色餐饮企业荣誉证书办理流程可能因颁发机构不同而有所差异，以下是几种常见的办理流程：
中国绿色饭店协会颁发
提交申请：企业在规定时间内向中国绿色饭店协会提交申请，填写《全国绿色餐饮企业荣誉证书称号申请表》。
审核材料：协会对企业提交的包括经营情况、食品安全、环保等方面的资料进行审核。
现场评审：审核通过后，协会派专家组对企业经营场所、设施设备、操作流程等进行现场评审。
公示：评审通过的企业名单在协会官网公示 7 天。
颁发证书：公示无异议后，协会颁发全国绿色餐饮企业荣誉证书并在官网公告。
商务主管部门颁发
准备阶段：
企业自评：企业按绿色餐饮标准进行自我评价，明确优势和不足。
资料收集：收集经营许可证、近三年财务报表、环境评估报告等证明材料。
编制申报材料：根据自评结果，编写包含企业基本情况、经营情况、绿色管理措施等内容的申报材料。
提交申请：
网上申报：企业在规定时间内登录全国绿色餐饮企业信息服务平台，填写信息并上传申报材料。
纸质材料提交：将申报材料打印成纸质版，加盖公章后，按属地管理原则，报送至所在地的区县商务主管部门。
审核阶段：
初审：区县商务主管部门对申报材料进行初步审核，筛选符合条件的企业。
现场核查：对初审通过的企业，商务主管部门组织专家进行现场核查。
综合评估：商务主管部门结合企业自评、申报材料和现场核查情况，对企业进行综合评估。
公示与授牌：
公示：通过综合评估的企业，在全国绿色餐饮企业信息服务平台上公示。
授牌：公示无异议后，商务主管部门授予企业绿色餐饮企业荣誉证书并颁发牌匾。
第三方认证机构颁发
提交申请：企业向第三方认证机构提出申请，提交企业简介、营业执照等相关材料。
材料审核：认证机构审核材料的真实性、完整性等。
现场审核：材料审核通过后，认证机构安排现场审核，检查企业实际情况是否符合绿色餐饮标准。
颁发证书：审核合格的企业，认证机构授予绿色餐饮相关认证证书。
