一、二者的申请办理实际意义不一样
3C认证实际意义反映在下边好多个层面：
1、國家强制产品质量认证规章制度的关键特性是，國家发布统一的文件目录，明确统一可用的国家行业标准、技术性标准和执行程序流程，制订统一的标识标牌，要求统一的资费标准。凡纳入强制产品质量认证文件目录内的商品，务必经國家特定的认证认证及格，获得有关资格证书并加施认证证书后，方可原厂、進口、市场销售与在运营服务项目场地应用。
2、依据在我国加入wto服务承诺和反映国民待遇的标准，原先两种制度遮盖的商品有138种。包括电缆电线、低压电气、信息科技机器设备、钢化玻璃、消防器材、机动车车胎、乳胶制品等。
3、依照世贸相关协议书和国际性行驶标准，國家依规对涉及到人们安全健康、动物与植物人身安全和身心健康，及其生态环境保护和信息安全的商品推行统一的强制产品质量认证规章制度。國家认证认同监管联合会统一承担國家强制产品质量认证规章制度的管理方法和机构执行工作中。
二、应用领域不一样
3C认证是强制认证，应用领域为中国内地地域；
CE认证都是ccc认证，应用领域为欧洲共同体27个國家和3个欧州自由贸易协议书国。
三、CE认证实际意义反映在下边好多个层面：
1、CE意味着欧州统一（CONFORMITEEUROPEENNE）。但凡具有“CE”标示的商品就可在欧洲共同体各组员中国市场销售，不必合乎每一理事国的规定，逐步实现了货品在欧盟国家范围之内的随意商品流通。
2、在欧洲共同体销售市场“CE”标示属强制认证证书，无论是欧洲共同体內部公司出产的商品，還是别的國家出产的商品，要想在欧洲共同体销售市场上随意商品流通，就务必印上“CE”标示，以说明商品合乎欧洲共同体《技术性融洽与规范化新方式》命令的基础规定。?它是欧洲共同体法律法规对商品明确提出的一种强制规定。
3、务必由公司总部欧盟国家的认证才能够批准资格证书。自80时代末至今，现有一批外资企业认证入驻我国。
四、资费标准不一样
國家统一明确强制产品质量认证收费标准新项目及规范。新的收费标准新项目和资费标准的制订，将依据不因盈利性为目地和反映国民待遇的标准，充分考虑现行标准收费标准状况，并参考海外类似认证收费标准新项目和资费标准。
CE认证的资费标准是依据商品要检测的新项目和挑选的组织相关。
