企业注销有很多种原因，对于企业破产的那种，其存货可能都用来抵债了，根本没有存货剩余，更不会出现注销多余存货这种事情。但是这只是针对企业破产情况，而现实中企业因歇业、解散、撤销等情形，注销税务登记和注销登记等情况时有发生。企业在注销登记时都或多或少有存货留存。
按税收政策规定，年应征增值税销售额在达到180万元以上的从事货物批发或零售的小规模纳税人和年应征增值税销售额在达到100万元以上的从事货物生产或提供应税劳务的小规模纳税人，应划转为一般纳税人企业进行管理。在划转时，如果小规模纳税人有存货余额的，由于小规模纳税人不具有增值税专用发票的使用权，而划转后的一般纳税人购进货物的进项税可以抵扣，因此原小规模纳税人可依存货购进价税合计金额到税务机关服务窗口开具增值税专用发票，并按政策规定完税，新划转的一般纳税人企业可将取得的税务机关开立的增值税专用发票上注明的增值税款进行抵扣。
