实例1：针对一般贸易的应急处理
某工厂出口一批玩具到美国后因包装问题退回香港，国内厂家一时无法向海关申请到质量不符退运的批文，工厂选择了将货品由香港直接运入保税区仓，在仓库改换包装，改换完毕后装柜交盐田/香港码头重新运往美国。
实例2：经济、快捷的转厂方式
某中山电子厂和深圳宝安某电子厂都是来料加工厂，中山电子厂生产的成品要卖给深圳宝安电子厂作料件，以往办理这种跨关区的“转厂”，手续很烦琐。现在两家工厂协商选择了保税区后一切都变得简单了：中山电子厂办理中山海关至福保海关的出口转关交货至保税区仓视同出境，再用深圳宝安电子厂的进口报关单办理货物的进口手续，货物的运输都是由国内车辆完成，这样给两家工厂节省成本。
实例3：国内产品与国外产品的简单装配
某公司需将国内生产的玩具和香港某公司生产的DVD光碟组合成成品玩具后销往欧、美洲：其国内工厂办理出口报关将玩具交至保税区仓，香港的DVD光碟则经一号通道进入保税区仓，安排工人在保税区将两种物品按客户要求包装于一体，再装入货柜转至盐田港后运至欧、美洲。
实例4：国际采购中心
某跨国公司在国内有遍布各地的数十个原材料供应商，他选择了保税区作为东南亚地区的配送中心。每天用国内车辆将各地供应商的货品转关或直接出口交货至保税区存放并进行集货，而海外供应商的货品则从香港通过一号通道进入保税区。达到一定量内再根据需要整柜送达全球各地，操作简化并可以节约很多运费。
实例5：国际配送中心
某公司是国内数十家工厂的原材料（塑料，钢材）供应商，其从国外批量采购后分批交给国内客户，因国内客户需求有时间差异，故其原材料要放在香港仓库储存，产生大量的仓储费用与装卸费，但如果选择保税区仓库做为配送中心，可节约大量的仓储费用及简化操作手续。
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形成真正的境外交易或国际结算，免征增值税与消费税，方便企业开展多种形式的国际贸易业务