二次供水设施的清洗消毒应当委托专业资格单位（经苏州市卫监所认定的），按照《苏州市二次供水水箱清洗技术规范》进行清洗消毒，清洗消毒后采样检测，取得水质检测专业机构出具的二次供水水质合格报告。二次供水设施管理单位在清洗消毒完成并取得有效水质合格证明后，应当及时做好服务对象公示工作，并向各区镇政府、区水务局和卫健委报送水质清洗消毒、合格证明、公示等有关资料。
二次供水设施管理单位应当对二次供水设施（包括泵房、贮水池、水箱或水塔和附属建筑物等）每六个月至少进行一次的清洗消毒，经有相应资质的检测单位检验合格后方可使用，并由管理单位向业主公示检验结果。
水箱应该多久清洗一次？一般来说，一年要清洗两次的。二次供水单位应当至少每半年对储水设施清洗、消毒1次。我国很多省市都发布了类似文件，但小区自来水箱未清洗、自来水二次污染严重的情况还是时有发生，这对小区居民的饮用水健康造成了很大威胁，这个看似棘手的问题该如何解决呢？
据了解，目前不少宾馆、饭店以及小高层、高层等都进行二次供水，但水箱清洗并不规范，有的单位自行清洗，有的清洗次数太少，没有达到一年至少清洗一次的标准。而清洗不规范，不仅水箱会出现锈蚀、渗水、设施陈旧老化等问题，水质的下降也影响用水市民的健康。王健表示，二次供水单位今后不能自行清洗水箱，应选择取得《上海市二次供水水箱清洗服务单位技术评估合格证书》的清洗服务单位进行清洗，否则，卫生行政部门将予以处罚。
次供水设施都采用无负压供水设备，采用水箱式二次供水设备的都是早期的。对于水箱式设备，因为各地二次供水条例规定的不同，其清洗频率也不一样。
二次供水水箱清洗与维护保养日程安排，并出具通知给用户，提前通知用户在某时间段内作好蓄水准备。一般建议避开用水高峰时间段。在规定好的时间段前提前关闭进水阀，并打开排污阀门。这里根据水箱大小和用水量而定提前时间的长短，混凝土蓄水池清洗工程，尽量确保在清洗时间前将二次供水水箱内的水排放到低水位。通过二次供水水箱的内外爬梯进入水箱内部，用干净拖把、抹布或冲洗加压设备对水箱周边及底部进行清洗。