一、功能上的共性
跨境海外仓系统、ERP、进销存软件都包含仓库管理模块，这是这三个软件的Zui大共性。
跨境海外仓系统（包括原料、半成品、成品管理）又恰恰是多数企业内部管理中Zui重要的部分：采购、生产、销售都是以库存管理为连接点，库存也是生产企业的Zui重要的成本。这也是三大管理软件让人产生混淆的原因。
二、功能上的区别
1、跨境海外仓系统：
和进销存软件比较，专业的仓储管理系统有以下功能变化：
1.1、加入了更多的作业策略管理和精细化作业具体的说，进销存软件是对企业的业务数据进行“事后记录”，有货品出入库时，在进销存软件中进行登记和单据打印。而WMS需要在业务实际发生前做出操作指引，比如说上架建议、拣货策略等等，根据软件设定的规则做智能化的分析，形成仓管员的Zui优化的操作指引。软件的操作记录，也更能反应实际情况，比如进销存软件往往不能支持一种物料入库时摆放到多个仓储位的情形，只简单给一个仓储位（WMS是在物料入库前，就自动分析出需要摆放多个仓储位和具体的、Zui优化的推荐仓储位）。
1.2、弱化了价格和财务管理功能
专业的跨境海外仓系统往往应用在第三方物流企业，物料进仓时不必关注采购价格，而是关注仓租费等物流费用的计算，WMS弱化了价格和财务管理。当然wms也会应用到制造企业。因为价格和财务管理在很多制造企业中是独立运作的，加上财务管理本身的规范性和财务软件的标准化，很多中型的制造企业采用的是“仓库管理软件+财务管理软件“的模式进行管理。
1.3、增加了“计费引擎”模块
跨境海外仓系统增加了独有的“计费引擎”模块，为物流计费提供支持。物流行业的计费规则往往非常复杂，比如仓储企业的仓租费用就包括：包仓、重量、托盘数、体积、物料属性、入库时间、期间天数等多个条件的排列组合，在加打折、分级价格等等因素，计费引擎的技术含量不亚于ERP系统的MRP计算。在制造企业中，计费引擎也可以帮助企业进行成本分析，计算仓库的使用成本。