微生物肥料检测除开有害物成份检测新项目外,也有性能指标的测定,关键包括了外型检测、合理活菌数检测(根瘤菌、固氮菌、铝硅酸盐细菌、磷细菌、甲基对硫磷细菌、无机磷细菌、复合型微生物菌种)、水份检测、粒度检测、土壤有机质检测、PH值检测、霉菌数检测及有效期限检测等新项目。
农作物在生长发育全过程中必须的化肥是各种各样的,单纯性应用微生物肥料肯定是不合理的。绿色食品验证除开生产过程无污染外,还包括了生态环境保护,生产加工包装方式等都必须进行一定检测规范的规定。因此应用微生物肥料只有说可能是绿色食品。全程仅用微生物肥料或是尚需认证的。