综保区与境外之间进出的货物，除有特殊规定的少量商品外（如精神药品、特殊种类冻鱼），原则上不实行进出口配额、许可证件管理。属于配额、许可证件管理的货物，出区进入国内或者国内货物出口入区时，才需要提供配额、许可证件。企业可以将进口时需要提交许可证件、配额的商品先行进口至综保区内，为办理相关许可证件争取时间，获得证件后再通关进口至国内。除了配额、许可证件管理外，减免税货物也可以享受有关优惠，如我国远洋渔业自捕水产品，在国外海域捕获并运回国内后，先行存入综合保税区或者保税仓库等保税监管场所，待办理完相关减免税手续后再进口至国内销售。
保税仓的作用是什么
公共保税仓库的设立可以促进加工贸易的快速发展。加工贸易的特点是两端都在外面。过去，由于企业基础差、起步晚、生产规模小、与外商沟通能力不足、外贸人才缺乏等因素，加工贸易的发展受到制约。
公共保税仓库的设立，使企业能够利用国外优质原材料，提高出口产品质量和国际市场竞争力，有效促进加工贸易发展。
保税仓库的作用
在降低运营成本方面发挥着重要作用。同时，对一般贸易中的出库货物也具有递延税金的作用。充分利用保税仓库的优势，进口高附加值、更新换代快、价值高的商品，以实现经济效益的大化。
1. 可以缩短进口原材料的采购时间，方便出口合同的履行。
出口产品大多以销售为主，出口交货期往往较短，原材料在国外采购又长又不方便。加工贸易虽然可以降低成本，但还是要靠国内原材料生产。公共保税仓库的设立，方便企业随时采购自己需要的进口货物，方便快捷，生产周期大大缩短。
2.有利于缩短进口资金占用的时间。
直接进口的原材料往往需要批量采购，需要大量资金；进口量大，生产周期长，资金占用时间长，不利于中小企业开展贸易。公共保税仓库的设立，有利于这种状况的改善。
3.可以降低企业进行加工贸易的风险。
企业批量进口原材料进行加工贸易，由于国际市场的变化，会导致部分合同履约不佳，国内销售税会增加成本，增加风险。公共保税仓库设立后，企业可以小批量采购原材料，有效降低经营风险。
4.可以减少企业缴纳的保证金，有效提高企业资金使用效率。
加工贸易国家限制进口的货物，向海关缴纳50%的税金。随着公共保税仓库的建立，企业可以小批量采购原材料，缩短从进口原材料到成品转售的周期，从而减少押金支付金额，提高资金利用率。
综保区内物流企业可以对保税货物开展流通性简单加工和增值服务，主要是分级分类、组合包装、打膜、刷贴标志、改变包装、拼装等辅助作业，以更利于运输或实现商品增值。例如，某电脑销售公司，将多家国内工厂生产的显示器、键盘、机箱等在综保区内装配组装，再将整机出口至欧美发达国家，改变此前各个工厂先将组件分别出口至中国香港或美国，再利用当地昂贵劳动力组装的境况。有的企业将从中国香港或者毗邻国家（地区）进口的大理石或花生等在综保区进行挑选（筛选）、分级、重新装箱后，再运至中国香港，虽产生额外仓储及运输费用，但相比在中国香港作业，成本仍然较低。
