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个人所得税方面，《财政部税务总局关于横琴粤澳深度合作区个人所得税优惠政策的通知》明确对在深合区工作的境内外高端人才和紧缺人才，其个人所得税负超过15%的部分予以免征。对在深合区工作的澳门居民，其个人所得税负超过澳门税负的部分予以免征，澳门税负参照澳门税法关于职业税、所得补充税等有关规定计算，营造税负与澳门趋同。
深合区税务局总会计师张惠冰在会上介绍，此次深合区在粤港澳大湾区个人所得税优惠政策基础上，扩展个人所得税15%税率优惠的人才范围，受益人才范围同步扩展至境内外，将会大大增强合作区招才引智的吸引力。
珠海纳金科技有限公司创始人、董事长雷震向记者表示，“税收的优惠是一项很直接的吸引力，尤其对于企业留人、用人提供了很大的支持和帮助”，特别是在招聘高层次人才和研发型人才方面，该项政策解决了企业用工难、引才留才等问题。
粤澳中医药科技产业园开发有限公司财务经理谢智向记者介绍，2018年时也推出了“澳人澳税”，但新政策的优惠力度更大，退税金额从原来可以退70%到现在90%。
苏崑在会上举例称，某澳门居民2021年在深合区工作，他的工资收入参照澳门居民收入中位数每月2万澳门元、13个月收入计算，一年的总收入合约22万人民币。在不考虑税收减免，按照现行内地个人所得税的有关规定，其应该缴纳1.4万元人民币的个税。但在使用了优惠政策以后，其仅需缴纳2300元人民币的个人所得税。
“对我来说是意外的惊喜，去年度我退了5万多元，相当于一个月薪水的一倍多。对于年薪一两百万元的高端人才来说，相当于每年多出几十万收入。”珠海横琴濠麦科技有限公司联合创始人、董事长龚元香是澳门居民，她告诉记者有很多澳门居民想来深合区就业，但担心深合区所需缴纳的个人所得税与澳门差异很大。新政策落地后，对于企业而言，可以吸引更多的澳门居民来深合区就业，企业成本也相对降低。
