在有资格的第三方认证机构申请办理。申请ISO9001质量管理体系认证的所需申请材料如下：iso9001质量管理体系认证申请书；企业营业执照副本和组织机构代码证的复印件；质量手册及程序文件；企业产品和服务流程说明书；企业基本情况及员工情况。认证证书的有效期为三年，取得证书后需要在有效期内至少一年一次接受认证机构安排的监督审核，在认证证书到期后，企业需要向认证机构提出复评的认证申请。
申请ISO9001方法如下：
1、第1步，向认证机构提交申请，进行合同评审环节，必要时认证机构应走访企业了解情况。
2、第二步，认证机构确定受理后随即签订合同。
3、第三步，认证老师对管理体系文件进行审查，不合格的企业进行修改，合格即进入现场审核准备。
4、第四步，现场审核，现场审核分为两个阶段，如未通过企业则需重新申请，审核通过则等待审批发证。
5、第五步，获证后需要每年进行监督管理，证书到期则需要进行再认证。
办理ISO9001认证条件：
1、拥有身份证明：营业执照或事业单位登记证书。
2、成立时间满足3个月。
3、有正常运营。
4、个别行业需要提供行业许可证（如建筑*资质、设计资质等）。
法律依据
《中华人民共和国行政许可法》 第三十九条
行政机关作出准予行政许可的决定，需要颁发行政许可证件的，应当向申请人颁发加盖本行政机关印章的下列行政许可证件：
（一）许可证、执照或者其他许可证书；
（二）资格证、资质证或者其他合格证书；
（三）行政机关的批准文件或者证明文件；
（四）法律、法规规定的其他行政许可证件。