一、 企业方面
企业的人员规模、认证范围、风险等级对认证机构认证费用的影响很大。
人员规模——这个很好理解，认证公司是根据企业人员数量安排审查时间的。人数越多，审查时间越长，审查成本也越高，相应的认证费用也就随之走高了。一般惯例是认证机构把人数规模划分了几个等级（45人以下费用低），每上升一级，认证费用（国内认证机构）会上升6000元左右。
认证范围——这个是指企业需认证的业务范围。比如搞生产的就比搞销售的贵出很多。给大家个形象参考吧，认证费用由低到高的顺序是：销售--服务--生产 。
风险等级——这个主要是指企业的行业和产品性质，比如搞化学品和医药的就贵很多。这个是源自认证机构对自身安全的考量，认证机构拿到资质不容易，如果经本机构审核认证过的企业出现严重质量事故，那可是要负责任的。所以认证机构审核高风险的企业审核成本不仅仅是人力成本了，更多的是潜在成本。高风险高回报嘛，要不然谁搞呢。大家都去搞纯销售的不危险的去了。
二、 认证机构
选择的认证机构不同，支出的认证费用也高低不同。
随着认证行业准许民营进入，目前市面上获认监委批准的ISO9001质量体系认证机构多达500多家，这也意味着认证机构也被迫进入了充分竞争的市场环境。你想想500多家拥有同等授权许可的机构，自然价格也就多样化起来了。所以选择不同的认证机构，相应的认证费用也就不同，价差高者能有3倍之多。
价差如此大的原因即是一些老牌的认证机构在初行业封闭的环境下（那个时候是认证方市场，想获得认证只能找他们）积累了一大批客户，也遗留了一些出身骄气。人不差客户，且不愿意做小客户，自然就价高了。而后来权限放开，越来越多的新机构进入，这些新机构需要市场，需要客户，自然就愿意降价了。 这就是价格差异化的原因。
总结一下，认证费用主要受到企业的人员数量，认证范围，风险等级以及选择不同的认证机构的影响而变化，且认证费用占据了企业总支出费用的90%。从企业视角来说，做个iso9001体系认证的总费用除了认证机构的认证费，还有咨询公司的咨询费以及审核人员必要的差旅住宿费。