医药工业洁净厂房的建筑围护结构和室内装修材料，应选用气密性好，且在温度和湿度变化作用下变形小的材料，饰面材料不应释放对药品质量产生不良影响的物质。厂房的内表面装修应符合下列规定:应平整、光滑、无裂缝、接口严密、无颗粒物脱落、易清洁、耐消毒；门窗、顶棚、墙板、楼地面的构造缝隙及施工缝隙应采取密封措施，墙面与地面的交界处应成弧形。踢脚不应突出墙面，厂房不宜采用砌体抹灰墙面，当必须采用时，抹灰层应有防开裂、防脱落措施，饰面层应易清洁、耐消毒。厂房的楼面、地面应符合下列规定:应满足生产工艺的要求；应整体性好、平整、不开裂、耐磨、耐撞击、防潮、不易积聚静电；地面应设防潮层，基层宜采用混凝土并设置钢筋网；地面应选用防静电、防滑、易清洁的PVC地板;吊顶则应选择易清洁、防霉、无菌的洁净板。厂房的窗应符合下列规定:洁净厂房和人员净化用室不宜设置外窗，当必须设置时，应采用断热型材中空玻璃固定窗，厂房观察窗宜与内墙面齐平，不宜设置窗台，无菌生产洁净厂房的观察窗宜采用双层玻璃，玻璃表面与墙面齐平。
医药洁净厂房的门应符合下列规定:门的尺寸应满足生产运输、设备安装维修、人员消防疏散的要求；门扇及其夹芯材料应采用不燃烧体，门应设闭门器。无窗生产洁净厂房的门宜设视窗，视窗宜采用双层玻璃，玻璃表面与门扇齐平。门宜向洁净级别高的方向开启，同一洁净度时，宜向空气压力高的方向开启。不同洁净级别房间之间的门应具有良好的气密性，厂房的门不应设置门槛。技术夹层的设计应符合下列规定:技术夹层的墙面、柱面和顶面应平整，当高效过滤器需在技术夹层内更换时，其墙面、柱面和顶面宜采用涂料饰面。采用轻质顶棚的技术夹层，宜设置检修走道，建筑风道和回风地沟的内表面装修，应与整个送风、回风系统的洁净要求相适应，并易于清洁。厂房内的色彩宜淡雅柔和，顶棚和墙面的光反射系数宜为0.60~0.80，地面的光反射系数宜为0.15~0.35。室内装修材料的燃烧性能应符合现行国家标准《建筑内部装修设计防火规范》的有关规定。