化妆品进出口权备案的申请流程主要包括以下步骤：
到商务局申请备案，7天后领取《对外贸易经营者备案登记表》。
到所属区县工商局变更经营范围，增加“货物进出口、技术进出口、代理进出口”，同时到所属区县公安局指定的地点申刻报关专用章，当天领取。
到所属区县管辖海关办理备案登记的相关手续，7天后领取《中华人民共和国海关进出口货物收发货人报关注册登记证书》。
到省级出入境检验检疫局办理注册备案登记，7天后领取《自理报捡单位备案登记证书》。
向中国电子口岸申请联合审批，约10天后取得入网许可，购IC卡、读卡器、操作系统，从而成为中国电子口岸正式会员。
到省级外汇管理局申请外汇帐户开立、出口核销备案。
在申请过程中，需要准备和提交的相关材料包括但不限于化妆品生产企业的营业执照、生产许可证、产品质量安全标准、产品检测报告、产品说明书、成分表、包装照片等。这些材料需要是真实有效的，并符合国家相关法规和标准要求。
此外，申请备案需要在国家药品监督管理部门指定的网上平台上进行。在填写过程中需要特别注意信息的准确性和完整性，确保信息的真实性和合规性。提交备案申请后，需要等待国家药品监督管理部门的审核。审核过程中，可能会需要提供额外的材料或进行现场核查。
请注意，以上流程可能因地区和具体情况而有所不同，建议在实际操作前咨询相关部门或机构以获取准确的信息。