保税仓库（保税存放进口货物）和出口监管仓库（保税存放待出口货物）是保税物流的基本形态和载体，特殊区域与这两者相比，主要是整合、集成、拓展了“保税仓库”和“出口监管仓库”功能，即货物从境外进入中心内实行保税，从境内进入中心享受出口退税，在中心内还能开展如保税仓储、简单加工和增值服务、国际物流配送、进出口贸易、国际中转和转口贸易、物流信息处理等多项业务，海关还赋予保税仓库一定的口岸功能。
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在深圳保税仓设立仓储基地的优势：
1. 中国是世界出口大国，而广东省更是全国出口货物的主要生产基地，在与生产商的距离方面，在深圳设立仓储配送基地比香港更有优势。
2. 深圳的人力资源成本只有香港的三分之一。
3. 丰富的仓库资源，开放的保税仓管理政策，在向海关进行报备后可以配合为客户设立各种功能性仓库。
4. 货物进出保税仓采用备案制的简单申报手续，提高货物配送时效。
5. “入区退税”、“暂缓交税”的政策优势，为企业减少资金压力，降低成本，增加货物销售的价格优势。
6. 货物可以在保税仓库无限期存放。
7. 保税仓库的货物可以不受限制地多方向流动。
