合理分配实验室空间，充分考虑供电（仪器设备用电量及插痤位置及照明、通讯及网络位置、UPS备用电源的配置）、供水（净化水、自来水及废液排放）、供气、通风、空气净化、安全措施、环境保护等基础设施和基本条件。如果需提供采集原始样品的设施，应在尽量优化样品采集条件的考虑患者的行动能力、舒适度及隐私。实验室应设计房间与控制的门禁系统门窗要求、结构工艺等设计要求墙面应光洁、无眩光、防潮、不起尘、不积尘；顶棚应光洁、无眩光、不起尘、不积尘。通用实验室不宜设吊顶，需设吊顶且无严格密封要求的空间宜采用活动板块式吊顶。实验室吊顶高度以2.6m高为宜，主实验室吊顶不能开设人孔或设备检修孔。用水量较多的实验室墙面、地面须考虑防水，地面应设地漏，实验室还应考虑到有内部通信联络系统和警报器。气体管道（设备配套气体气泵位置及降噪措施），室内应减少突出的建筑构配件及明露管道。实验室的门应有可视窗并可闭锁，门锁及门的开启方向应不妨碍室内人员逃生。实验室应设洗手池,洗手池宜设置在靠近实验室的出口处。在实验室门口处应设存衣或挂衣装置，可将个人服装与实验室工作服分开放置。实验室主入口的门、放置生物安全柜实验间的门应可自动关闭。实验室的墙壁、天花板和地面应易清洁、不渗水、耐化学品和消毒剂的腐蚀,地面应平整、防滑，不应铺设地毯。
实验室应根据工作性质和流程合理摆放实验室设备、台柜、物品等，避免相互干扰、交叉污染，并应不妨碍逃生和急救。实验室台柜和座椅等应稳固，边角应圆滑，以防意外伤害，实验室应有足够的空间和台柜等摆放实验室设备和物品。实验室台柜等和其摆放应便于清洁，实验台面应防水、耐腐蚀、耐热和坚固。实验室可利用自然通风，如果采用机械通风，应避免交叉污染，如果有可开启的窗户，应安装可防虫的纱窗。实验室设计应避免不必要的反光和强光。实验室应设置应急照明装置，应有足够的电力供应设计时应考虑预留发展所需备用电量。应有足够的固定电源插座，避免多台设备使用共同的电源插座，应有可靠的接地系统，应在关键节点安装漏电保护装置或监测报警装置。供水和排水管道系统应不渗漏，下水应有防回流设计。应配备适用的应急器材，如消防器材、意外事故处理器材、急救器材等。应配备适用的通讯设备。配备适当的消毒设备。空气消毒可使用紫外灯（安装的高度和定时开关）或带循环风的空气消毒设备（臭氧发生器风循环）。若使用高毒性、放射性等物质，应配备相应的安全设施、设备和个体防护装备，应符合国家、地方的相关规定和要求。若使用高压气体和可燃气体，应有安全措施，应符合国家、地方的相关规定和要求。仪器接地（仪器电源要求），应特别注意无菌、灰尘、电磁干扰、辐射、湿度、电力供应、温度和声音及振动水平等。实验用房、走道的地面及楼梯面层，应坚实耐磨、防水防滑、不起尘、不积尘。