毒理学指标：相关标准还要求饮用水中的氟化物必须小于1.0 毫克/升；汞小于0.001 毫克/升；氰化物、砷、铬（6 价）、铅、银均小于0.05 毫克/升；硝酸盐（以氮计）小于20 毫克/升；氯仿小于60 微克/升；小于3 微克/升；硒、镉、苯并（a）芘小于0.01 微克/升；滴滴涕小于1 微克/升；六六六小于5 微克/升。
细菌学指标：《生活饮用水卫生标准》中规定，饮用水中的细胞总数必须小于100 个/升；总大肠杆菌小于3 个/升；游离余氯在与水接触30 分钟后应不低于0.3 毫克/升。而集中式给水的出厂水不仅要必须符合上述要求外，还需要符合集中式给水卫生规范中的相关规定。
放射性指标：总α放射性小于0.1 贝可/升；总β放射性小于1贝可/升。
近些年来，随着我国工农业的快速发展以及人口的不断增多，水污染问题是日趋严重，再加上各种水污染事故的频繁发生，水质问题时刻牵动着人们的神经，而如何保证水质安全也成为了人们关注的重中之重，那么水质检测就是确保水质安全的重要的措施。
水中所含化学物质及放射性物质不得危害人体健康（不得引起急性中毒、慢性中毒、致癌、致畸形等）。某些地区因地球化学成分异常使得水源水中某些有害的化学物质增多，可以引起地方病，称为地球化学性疾病。例如地方性氟中毒、地方性砷中毒等。