深圳海关针对金关工程（二期）加工贸易管理系统切换后，企业可能遇到的问题进行了详细的解答，以下为部分内容：
一、关于深加工结转业务的办理
金关二期系统切换后，深加工结转业务有了新的办理流程。对于底账间的结转业务，应通过“金关二期保税流转系统”办理，企业需按规定格式申报相关表格，并根据收发货情况汇总申报。对于与H2010系统底账间的结转业务，取消了部分审核环节，双方企业在实际发货及收货后需及时申报相关清单和报关单。
二、现有H2010系统手（账）册剩余料件结转问题
企业无需再办理余料结转申请表，而是直接申报保税核注清单及报关单，简化了办理手续。
三、内销征税业务的办理
金关二期系统切换后，加工贸易货物申请内销时，企业无需再申报内销征税联系单，而是直接申报内销核注清单，并以此为基础申报内销报关单，提高了办理效率。
四、外发加工业务的办理
企业需按规定格式向海关发送相关备案表和收发货单，建议通过电子口岸预录入系统以电子形式申报，方便了企业的操作。
五、其他业务办理方式
加工贸易货物的存放场所变更、销毁处置、料件串换、受灾保税货物管理、抵押等业务，企业应通过深圳海关网上办事大厅的相关业务模块进行申请办理。
六、集中申报模式的适用
海关总署正在开发相关系统，以实现金关二期系统与H2010集中申报管理系统的数据对接。待系统上线后，符合条件的企业经海关核准，可继续采取集中申报模式办理进出口手续。
金关二期系统切换后，企业在申请加工贸易手册设立时，对“关区代码”、“进出口岸”和“单耗申报环节”等栏目的申报也有新的要求，企业需要按照相关规定进行准确填报。
对于有意参加“以企业为单元改革”试点的加工贸易企业，深圳海关将选取部分企业进行改革试点，并会在条件成熟时逐步推大试点范围。有意向的企业需留意海关后续发布的相关信息。
这些解答旨在帮助企业更好地理解和适应金关工程（二期）加工贸易管理系统的变化，确保业务的顺利进行。
